有關德國大腸桿菌事件的追蹤 (代發)

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本篇為生科專家所寫,小弟只是代發而已,若有最新狀況會更新

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這一次德國所爆發的細菌性中毒疫情, 是由腸出血性大腸桿菌 (Enterohaemorrhagic E. coli), 所造成的. 這株大腸桿菌在之前的研究中從來沒有被發現過, 是一個新菌株.

 

根據中國深圳的華大基因研究院所完成的基因序列分析結果, 發現這株菌和之前在中非共和國所發現的編號 EAEC 55989 E. coli 93%的相似度

 

華大基因研究所對該菌株的簡要說明.

 

致命大肠杆菌起源新线索 2011-06-05 00:03:07

65日,深圳华大基因研究院研究小组通过多位点测序分型( Multi Locus Sequence Typing, MLST),发现引起此次爆发的菌株与2001年在欧洲分离的菌株01-095912002年的中非分离株55989有高度相似性。这三株菌具有7个完全相同的“看家基因”,(“看家基因”被广泛用于细菌分类),从而得出结论该三类大肠杆菌为同一类型(ST678)。

 

根据这个发现,研究小组对这三株菌展开进一步调查,通过对大肠杆菌的12个毒力基因/适应基因分析发现,2001年欧洲分离株与今年的爆发菌株完全吻合,而中非菌株与其他两株欧洲菌株相比,缺少了志贺毒素基因和抗亚碲酸盐基因。研究人员据此推测,2001年的欧洲分离株很有可能是这次爆发菌株的直接祖先。抗生素抗性试验结果表明,经过10年的进化,2011年的菌株可能获得了一些新的基因,从而具有了耐更多种抗生素的能力。

 

通过对2001年与今年爆发菌株的基因组比较分析,将极大的助于进一步阐明为什么导致这次疫情的菌株致病能力如此之强;并将为疾病的起源、传播和控制提供线索。这将为一线医护人员应对和控制全球疫情扩散提供更有力的支持。

 

研究人员正在联系寻找2001年欧洲菌株的样品及相关信息,并继续进一步的分析研究。

 

华大基因已将最新的基因组序列发布在NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/67657)及网站连接 (ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/Ecoli_TY-2482)

 

 


這株菌被認為有超級毒性, 因為他有部分的基因和沙門氏菌 (Salmonella enterica) 相同, 並且它還具有更強力的β-lactamases酵素, 可以抵抗多種抗生素

 

而且, 如果用抗生素去治療時, 細菌本身會製造出更多的 志賀菌毒素 (Shiga toxin, 志賀氏桿菌毒素, 和大腸桿菌O157一樣)

 

這株菌的直接祖先是E. coli O25:H4-ST131. 這是一株分布在
洲的菌株. 而超級毒素的來源應該是來自於水平轉殖.

 

以上的資料分別來自於 nature science以及華大基因網站

 


這株菌還有一個特點, 它是可以抗tellurium dioxide (二氧化碲)的菌株, 而二氧化碲則是在抗生素尚未發現以前拿來治療細菌性疾病的常用藥.

 

所以Nature推測它可能存在於電子業的工廠環境中, 由環境中自然篩出來的.

 

然而不管是那一個期刊, 他們都同意該菌株的某些基因是來自於水平轉殖 (horizontally transfer)

 

這種基因轉殖方法是現代生物研究中的一個基本工具, 任何實驗室都可以獨力完成基因轉殖, 但是, 自然界也存在這種水平基因轉殖的機制, 我們不能排除自然界形成這種超級毒菌的可能性.

 

然而, WHO的專家卻認為, 在食物鏈中, 從來沒有發現過這株菌, 這是有點不可思議的.

 


簡單說明到此, 最重要的問題有

 

1. 基因定序結果令人疑惑, 太快, 又提供了很多資訊…(這不是我說的, Microbial genomicist Frederick Blattner of the University of Wisconsin, Madison說的)

 

2. 序列的分析提供到資料庫NCBI, 但是和抗藥性最相關的質體序列分析卻沒有

 

3. 這株菌結合了太多外來基因, 雖然說多重抗藥性的細菌已經很常見, 但是, 通常是會出現在重要的致病菌上, 像是肺結核菌, 而大腸桿菌這種非致命性的細菌要出現如此多重抗藥性, 的確是很難, 因為在治療大腸桿菌所引起的疾病, 通常不會用抗生素

 

4. 志賀菌毒素是之前大腸桿菌O157所產生的一種毒素, 而當時, O157也曾經被懷疑是某種生物戰劑.

 

這次的感染性影響全歐洲, 再加上消息傳遞又一直出錯, 不得不讓人覺得疑惑

 

還好是E. coli是可以被煮熟的, 志賀菌毒素也不耐
, 所以, 生菜沙拉少吃, 保命重要

 


最新, 豆芽也不是致病源, 這下有趣了

 

德傳媒指豆芽種子來自中國


看看歐盟發的新聞稿, who的新聞, 注意一下英法的立場, 看起來英國好像是事不關已, 法國是農業大國, 損失應該也不會太小, 德國是反對貸款給PIIG的, 是不是有人用這招在搞德國?

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